异噻唑啉酮是一种广谱、高效且低毒的灭菌剂，大范围的应用于水处理、钢铁锻炼、油田灌水、造纸厂等多个工业范畴。其灭菌原理是经过损坏细菌细胞内的DNA分子，使细菌失掉活性。因为其优异的功能，异噻唑啉酮被认为是现在最好的灭菌剂之一。
在安全方面，异噻唑啉酮归于低毒物质，依据LD50值（3350mg/kg），其毒性较低。但是，尽管毒性较低，但在运用和贮存过程中仍需注意安全。异噻唑啉酮对皮肤和眼睛有刺激性，假如触摸皮肤或眼睛，需立即用很多清水冲刷，并就医处理。误食异噻唑啉酮应立即漱口、催吐，并敏捷就医。
在操作异噻唑啉酮时，一定要采纳一系列维护措施。佩带安全防护面罩或眼镜以维护眼睛，穿作业服以避免皮肤非直触摸摸，戴橡皮防腐手套以维护手部。此外，作业后应进行淋浴更衣，坚持杰出的个人卫生习惯。
贮存异噻唑啉酮时，应将其放在阴凉、通风的仓库内，避免与氧化剂、还原剂、胺类等禁配物触摸。贮存温度应在-10℃至40℃之间，保证容器严密密闭，并远离火源。若产生走漏，少数溅起可用干土、黄砂等资料吸干或掩盖，然后送入容器；很多走漏则需围堰以便后处理。
尽管异噻唑啉酮具有低毒的特性，但在运用的过程中仍需严厉依照安全操作标准做处理，保证人员和环境的安全。
